Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA10Q9GZZ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA10Q9GZZ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA10Q9GZZ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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