Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRC27Q9C0I9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms