Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NLRP1Q9C000 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NLRP1Q9C000 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms