Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM3Q9BZQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM3Q9BZQ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms