Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKD2Q9BZL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKD2Q9BZL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKD2Q9BZL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms