Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB1Q9BZB8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms