Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS2Q9BXC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms