Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFJQ9BTM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFJQ9BTM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms