Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRACR2AQ9BSW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms