Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF4Q9BSR8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF4Q9BSR8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms