Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPKQ9BS16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPKQ9BS16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms