Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK1Q9BRS2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK1Q9BRS2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK1Q9BRS2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms