Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF2Q9BQY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms