Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGRRF1Q99675 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGRRF1Q99675 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms