Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF6Q99612 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF6Q99612 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms