Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN18Q96SJ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN18Q96SJ8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms