Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPK1Q96SB4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms