Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KC1Q96S38 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KC1Q96S38 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms