Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
LMTK3Q96Q04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LMTK3Q96Q04 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms