Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD4LQ96PU5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD4LQ96PU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4LQ96PU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms