Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGAP3Q96P47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms