Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD11Q96NU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD11Q96NU1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms