Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC46A1Q96NT5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A1Q96NT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms