Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC115Q96NT0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC115Q96NT0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms