Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSNARE1Q96NA8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms