Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms