Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF778Q96MU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF778Q96MU6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms