Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms