Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF488Q96MN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms