Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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