Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHAMP1Q96JM3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAMP1Q96JM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms