Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPD52L3Q96J77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPD52L3Q96J77 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPD52L3Q96J77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms