Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPNQ96H22 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPNQ96H22 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms