Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNF8Q96H20 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms