Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APIPQ96GX9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APIPQ96GX9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APIPQ96GX9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms