Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
BCANQ96GW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
BCANQ96GW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms