Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP36Q96G28 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP36Q96G28 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP36Q96G28 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP36Q96G28 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP36Q96G28 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP36Q96G28 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP36Q96G28 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP36Q96G28 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms