Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IMP4Q96G21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IMP4Q96G21 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms