Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGAP3Q96FM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGAP3Q96FM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGAP3Q96FM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms