Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RNFT2Q96EX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RNFT2Q96EX2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RNFT2Q96EX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms