Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPACA9Q96E40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPACA9Q96E40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms