Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP4Q96DX8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTP4Q96DX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP4Q96DX8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms