Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGBD4Q96DM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD4Q96DM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD4Q96DM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms