Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC11Q96DB2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC11Q96DB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC11Q96DB2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms