Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL29Q96CT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms