Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTHRC1Q96CG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTHRC1Q96CG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms