Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDF1Q96CC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms