Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RUNDC1Q96C34 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RUNDC1Q96C34 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
RUNDC1Q96C34 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RUNDC1Q96C34 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms