Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2E3Q969T4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2E3Q969T4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms