Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN3Q969G5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN3Q969G5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms